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科技創(chuàng)新工程采用績效管理方式對(duì)研究所和科研團(tuán)隊(duì)進(jìn)行管理與考評(píng)。

采取分級(jí)考評(píng)，農(nóng)業(yè)農(nóng)村部、財(cái)政部考評(píng)農(nóng)科院、農(nóng)科院考評(píng)研究所、研究所考評(píng)科研團(tuán)隊(duì)。采取分期考評(píng)，年度監(jiān)測，三年中期評(píng)估，五年期滿考評(píng)。采取分類考評(píng)，院對(duì)研究所考評(píng)按照作物園藝類、畜牧獸醫(yī)類、其他專業(yè)類分組進(jìn)行。

院與研究所、研究所與科研團(tuán)隊(duì)簽訂任務(wù)書，從體制機(jī)制創(chuàng)新、科技創(chuàng)新、成果轉(zhuǎn)化與貢獻(xiàn)、人才團(tuán)隊(duì)建設(shè)、科研條件建設(shè)、國際合作與交流、資金使用與管理等方面明確任務(wù)目標(biāo)，進(jìn)行全面綜合評(píng)價(jià)，避免“四唯”。

考評(píng)結(jié)果與目標(biāo)校正、動(dòng)態(tài)管理、績效預(yù)算等直接掛鉤，提高財(cái)政資金使用效率。考評(píng)結(jié)果為“較差”的研究所，將被核減科技創(chuàng)新工程經(jīng)費(fèi)，考評(píng)結(jié)果為“較差”的科研團(tuán)隊(duì)，將退出科技創(chuàng)新工程或被核減科技創(chuàng)新工程經(jīng)費(fèi)。