近日,中國農業科學院深圳農業基因組研究所(嶺南現代農業科學與技術廣東省實驗室深圳分中心)動物功能基因組學創新團隊構建了迄今為止最全面的豬基因組結構變異圖譜。相關研究成果發表在《基因組生物學(Genome Biology)》上。
豬是最重要的家畜之一。此前有研究表明豬的重要經濟性狀(生長、飼料效率和健康等)與結構變異有關,但由于受樣本量、品種、技術手段等因素的限制,無法對其相關性進行精準評估,阻礙了豬的品種改良進展。
為此,研究人員收集了全球101個豬品種,共1060頭豬的基因組測序數據,構建了豬基因組的全面結構變異圖譜,鑒定到數百萬個結構變異事件。利用歐洲和亞洲豬品種之間的結構變異重建了品種的祖先和雜交過程,解析了結構變異對基因表達、功能元件和經濟性狀的影響。該研究為豬的品種改良奠定了理論基礎。
該研究獲得國家重點研發計劃、國家自然科學基金等項目的支持。(通訊員 馬昕怡)