近日，中國農業科學院深圳農業基因組研究所農業宏基因組學創新團隊構建了六倍體菊芋染色體級別參考基因組，解析了菊芋基因組起源和演化過程，為向日葵屬作物的起源進化研究、抗逆基因挖掘、育種改良和工業化利用提供了寶貴的資源。相關研究成果發表在《植物通訊（Plant Communications）》上。
菊芋俗稱洋姜，兼具生態防護和經濟利用雙重價值，然而菊芋基因組極其復雜，基因組的測序組裝面臨重復序列比例高、雜合度高、染色體數多等挑戰，其六倍體基因組至今仍未破譯。
研究人員利用測序等技術，完成了六倍體菊芋的高質量染色體級別組裝，基因組組裝大小為10.5 Gb，共含有199842個蛋白編碼基因。研究首次發現，菊芋約2百萬年前發生了全基因組三倍化事件，是菊芋形成六倍體的主要原因。
該研究得到國家重點研發計劃、深圳市基礎研究項目、深圳市重點實驗室基金和農業科技創新計劃的支持。（通訊員 馬昕怡）
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https://doi.org/10.1016/j.xplc.2023.100767
