近日,中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院棉花研究所野生棉課題組聯(lián)合國(guó)內(nèi)外多家研究單位,在全基因組水平探討了四倍體棉種的多倍化、適應(yīng)性進(jìn)化與馴化,揭示了棉花多倍化及人工馴化過程的遺傳變異基礎(chǔ),為其他農(nóng)作物多倍化研究提供了理論基礎(chǔ),為棉花育種創(chuàng)新提供了種質(zhì)資源。相關(guān)研究成果發(fā)表在《美國(guó)國(guó)家科學(xué)院院刊(PNAS)》上。
多倍化是植物進(jìn)化的重要機(jī)制,使得多倍體植物具有廣泛適應(yīng)能力。常見的多倍體植物有六倍體小麥、四倍體棉花和馬鈴薯等。異源四倍體棉花包括陸地棉、海島棉、毛棉、黃褐棉、達(dá)爾文氏棉、艾克曼棉和斯蒂芬氏棉等7個(gè)棉種,其中前5個(gè)異源四倍體棉種的基因組序列已公布,而最新被發(fā)現(xiàn)命名的野生棉——艾克曼棉和斯蒂芬氏棉的基因組圖譜尚未被報(bào)道。解析艾克曼棉和斯蒂芬氏棉的基因組信息,標(biāo)志著異源四倍體棉花演化拼圖的全部完成,對(duì)分析棉花多倍化及進(jìn)化機(jī)制具有重要意義。
該研究對(duì)艾克曼棉、斯蒂芬氏棉和一個(gè)陸地棉野生種系進(jìn)行測(cè)序,解析了棉花多倍化及適應(yīng)性進(jìn)化過程中廣泛存在的基因組結(jié)構(gòu)變異。結(jié)合四倍體棉種表型分化、遺傳隔離和遺傳趨同等,闡述了棉花生物多樣性和棉花馴化的遺傳基礎(chǔ),發(fā)現(xiàn)野生棉對(duì)馴化棉種在適應(yīng)性方面有較強(qiáng)的基因滲入。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),棉花馴化過程中編碼磷酸肽結(jié)合蛋白的基因結(jié)構(gòu)變異可能與纖維長(zhǎng)度有關(guān),烯酰輔酶Aδ異構(gòu)酶3和乙烯響應(yīng)因子RAP2-7可能通過調(diào)節(jié)植物激素相關(guān)的生化途徑,提高棉花非生物脅迫耐受性。該研究結(jié)果填補(bǔ)了多倍體棉花系統(tǒng)發(fā)育研究的空白,揭示了棉花多倍化過程中的適應(yīng)性進(jìn)化機(jī)制,為棉花抗性和纖維品質(zhì)遺傳改良提供了寶貴的遺傳材料。
該研究得到國(guó)家自然科學(xué)基金等項(xiàng)目資助。(通訊員 梁冰)
原文鏈接:https://doi.org/10.1073/pnas.2208496119