由中國農業科學院中日農業技術研究發展中心與日本國際協力機構（JICA）共同承擔的中日兩國技術合作的重點項目，“中國可持續農業技術研究發展計劃――環境友好型農業技術開發與推廣”項目（以下簡稱中日項目二期），于2009年10月12日，在中國農業科學院中日農業技術研究發展中心召開了項目啟動大會和項目監督委員會第一次會議。農業部、科技部、中國農業科學院、中國農業科學院中日農業技術研究發展中心的領導與專家，日本農林水產省、日本駐中國大使館、日本國際協力機構（JICA）等日方官員和專家60余人參加了會議。
中日兩國政府代表于2009年2月19日，簽署了中日項目二期實施計劃會談紀要（R/D），標志著中日項目二期實施獲得官方批準。中國農業科學院中日農業技術研究發展中心在成功執行一期項目的基礎上，在2009年4月至2014年3月的5年期間，將繼續與日本國際協力機構（JICA）合作，開展以環境友好型農業技術開發與推廣為主，重視行政部門的指導和調整，兼顧技術的開發和推廣的中日二期項目。中日二期項目將在湖南、山東和寧夏等示范地區，開展水質、土壤監測技術與評價指標體系、環境友好型農業技術、能力建設及技術示范推廣等方面的研究與推廣工作。項目的目標是控制并改善示范地區的灌溉排水、地下水、土壤、大氣的污染程度。預期成果包括：確立水質、土壤監測技術與評價指標體系；開發并驗證農業環保技術，包括環保型農業技術、土壤和水污染修復技術；推動農業環保及修復工作的農業環保相關人員的能力得以加強；示范地區的農戶采用農業環保技術。
科技部、農業部及中國農業科學院的領導在項目啟動會上表示，今后將一如既往地支持中日項目的工作。期待中日項目二期在打造國際合作隊伍、提升創新團隊能力、擴大成果推廣、密切地方政府合作和機制創新上取得新進展。希望項目執行各方按照項目實施計劃，落實工作責任，建立穩定的工作團隊，深化與日方的合作，力爭取得雙贏的局面，為中日兩國技術交流與合作做出更大的貢獻。同時，對項目實施過程中加強項目管理、推進實用技術的推廣和加強培訓工作等提出了具體要求。日方代表也對中日項目二期的啟動寄予了很高的期望，對加強中日技術交流、擴大成果應用和提供技術服務等方面提出了要求和建議。
在中日項目二期監督委員會第一次會議上，審議和討論了中日項目二期各課題2009年的工作報告和下階段的工作計劃，并對完善課題計劃、項目基地建設、課題預算執行、項目儀器申報、赴日進修計劃等事項做了安排。會議認為，中日項目二期順利啟動，項目前期工作平穩有序，為成功實施項目計劃奠定了堅實的基礎。
