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    麻類研究所2004年改革目標是：調整機構設置，發展壯大科技產業，加大行政管理改革力度，向市場要效益。
    該所打破事業單位建制，組建了新的機構：科技創新中心、產業開發機構及職能服務部門，崗位職數共計91個。創新中心分8個項目組，崗位職數30個；產業開發機構分7個事業部，崗位職數44個；職能服務部門崗位職數11個。
    一、職能部門人數減少，人員素質提高
    通過全所競爭上崗、全員聘用和領導干部交流輪崗，有6名處級領導實行了輪崗。改革后職能部門的人數由18人減到11人，實現了一人多崗，一人多職。改革前，職能部門有碩士1人、大學本科4人，平均年齡47.8歲；改革后有博士2人、碩士1人、大學本科5人，平均年齡37.5歲。
    二、創新力量得到集成，研究方向進行了調整
    研究所根據自身創新優勢，確定了8個研究方向。以8名院二、三級崗位杰出人才為龍頭，從70余名科技人員中遴選出30名科技骨干，形成了科技創新中心。
    各課題組有權決定課題的人、財、物的調配和收入的分配。創新中心運用已建成的幾個國家麻類技術創新平臺，以國家自然科學基金、863、973前期等項目為突破口，在繼續爭取國家重大項目的基礎上，將研究方向轉到為事業部提供具有源創性的可物化的新產品、新技術上，將立項原則從傳統的研產銷一體化轉移到銷研產一體化，從而使科研成為產業開發的堅實后盾。
    三、產業發展力量得到加強，政策更加優惠
    有30余名原長期從事科技工作的技術人員和輔助人員以及7名從行政崗位上分流出來的管理人員被充實到產業開發第一線。這些同志擁有相關的科技開發技能、項目經費和應用技術，也具有吃苦耐勞的精神和管理經驗，將成為研究所產業開發的主要力量。
　各事業部有用人、用財和業務經營自主權。事業部的經理有權決定本部門其他成員績效工資額。研究所對從事開發經營的各個事業部提供啟動金和開辦費。此外，各事業部從事開發經營活動所需的流動資金，研究所可以給予貸款或協助向銀行申請貸款。
四、分配制度改革
　研究所高層管理人員和院二、三級崗位杰出人才實行年薪制；開發業績突出并完成公司開發創收任務的事業部經理，除基本工資外，還可獲得6萬元的年績效工資；其他員工實行基本工資、崗位工資、績效工資和福利相結合的工資制度。
五、試行內退制度
　對距法定退休年齡5年以內的4名職工辦理了內退手續。為了讓這部分職工安心內退，支持研究所的改革工作，除發給基本工資、生活補貼、誤餐費和享受其他福利以外，內退期間還可享受增加一級工資的待遇。
六、轉制過程中存在的問題及建議
1、麻類作物有特殊性，建立支柱產業難度大
　麻類產品是我國的傳統出口產品和勞動密集型產品，麻類產品戰線長，麻類作物種植面積僅千萬余畝，而且苧麻屬無性繁殖作物，種子市場有其局限性。因此，建立支柱產業難度較大。
2、社會保障體系不健全
　由于一些配套措施跟不上或未能及時在地方貫徹落實，導致職工對轉制存在畏懼心理。湖南省目前只啟動了企業單位的社會養老保險，尚未將事業單位（全額撥款）的養老保險納入社會統籌。因此麻類所轉制為科技型企業后，需向當地社會保險機構繳納巨額養老保險費后，方能入保。請上級部門予以關注并幫助解決。
3、歷史負擔沉重
　研究所現有農工的比例幾乎占在職職工的一半，這部分人在企業轉制中難以發揮作用，給轉制工作造成較大困難。因此，必須在上級部門的幫助下，通過制定切實可行的人員分流辦法，才能達到精減富余人員的目的。